公积金还款可以从公积金账户中扣款。公积金还款是否是从公积金账户中扣除主要是看用户的选择，公积金贷款每月还款可以从公积金账户扣除，也可从银行的储蓄账户中扣款。多数情况下，申请者需要提供给银行的是自己的还款账户，用户可以选择适合自己的还款账户即可。

从公积金账户扣除需要去办理公积金冲还贷的业务，每月还款日的当天才会自动从账户中扣除。

从银行的储蓄账户中扣款。借款人需在每月还款日前按照贷款还款计划表上的本息金额将款项存入己开立的储蓄卡中，等到还款日当天，银行会自动扣除。如果未及时存款或存款余额不足的从21日开始按罚息利率计算并收取滞纳金。