支付宝信用卡还款高于2000元时是需要手续费的。我们使用支付宝还信用卡时，每人每月都有2000的基础免费还款额度，用户的累计还款金额低于2000时，还信用卡就免费。如果累计还款金额超过2000，那么支付宝会收取手续费，费用是超出部分的0.1%，单笔服务费小于0.1元的，按照0.1元收取。另外，支付宝用户可以使用支付宝会员积分兑换更多的信用卡免费还款额度。