支付宝基金赎回后资金会到余额宝中，这是支付宝平台设置的规则，只要开通了余额宝，通过支付宝购买的基金、理财、黄金等产品，卖出后资金都是转到余额宝里。在使用支付宝付款也是一样，假如是从银行卡里扣款的，产生的退款同样是退回到余额中。

另外，支付宝属于基金的代销平台，支付宝上的基金属于开放式基金，申购赎回一般遵循T+1的原则。